Si necesitas sincronizar el contenido de dos carpetas, puedes utilizar este programa gratuito que ofrece Microsoft que lo hará por tí y automáticamente.

Luego de instalarlo y ejecutarlo, te aparecerán dos ventanas, una a la derecha y otra a la izquierda y el programa sincronizará el contenido detectando archivos repetidos, borrados, etc y dejando las dos carpetas totalmente iguales. Esto es muy útil, por ejemplo cuando estamos manipulando fotogarfías desde y hacia un pendrive ó  sincronizadno el contenidos de nuestros archivos en nuestra computadora de escritorio y nuestra laptop, por ejemplo.

También puedes utilizarlo para hacer backups de tus datos.

Para bajar este programa, puede hacerlo en el siguiente enlace  SyncToy2.1